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Bases de datos en Biología Molecular. Bases de datos de secuencias de DNA y proteínas. Bases de datos de estructuras tridimensionales de ácidos nucleicos y proteínas. Otras fuentes de información. 

Teoría: Bases de Datos en Biología Molecular (pdf).

Links: 

Documentación adicional:
Práctica 1. Acceso guiado a alguna de las principales bases de datos.
1.- Buscar datos relacionados con la enfermedad metabólica "HMG CoA lyase deficiency" en los siguientes repositorios de información:
OMIM: Online Mendelian Inheritance in Man:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?db=omim
PubMed:  a service of the U.S. National Library of Medicine that includes over 21 million citations from MEDLINE and other life science journals for biomedical articles back to the 1950s:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?db=pubmed
NCBI: National Center for Biotechnology Information (USA):
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/About/index.html
SRS-EBI: Sequence Retrieval System at the European Bioinformatics Institute (EBI), part of the European Molecular Biology Laboratory (EMBL):
http://srs.ebi.ac.uk/
http://www.ebi.ac.uk/
PDB - PDBe server: Protein Data Bank (macromolecular 3D structures):
http://www.rcsb.org/pdb/
http://www.ebi.ac.uk/pdbe/
Nota: descargar las estructuras a un directorio local y visualizarlas con "rasmol".
2.- Repetir la práctica anterior buscando información relevante sobre la enfermedad metabólica: "Carnitine palmitoyltransferase deficiency" (OMIM database), y las proteínas "carnitine acetyltransferase" y "carnitine octanoyltransferase" (PubMed, NCBI, SRS-EBI, PDB).
Práctica 2. Gene Ontology Database. 
      Gene Ontology (GO) database. The Gene Ontology project provides a controlled vocabulary to describe gene and gene product attributes in any organism.
      http://www.geneontology.org/  Buscar los siguientes términos: 
    • Hydroxymethylglutaryl-CoA lyase
    • Transcription factor
    • DnaK
    • OCTC_HUMAN


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Coordinador:
Dr. Paulino Gómez-Puertas.
Grupo de Modelado Molecular. 
Centro de Biologia Molecular "Severo Ochoa" (CSIC-UAM).
C/ Nicolás Cabrera, 1.
Campus UAM. Cantoblanco, 28049 Madrid. Spain
Tel: (+34) 91-196-4663/4662   Fax: (+34) 91-196-4420
2012
bioweb: Molecular Modelling Group

Biomol-Informatics SL