bioweb: molecular modelling group / grupo de modelado molecular

http://www.cbm.csic.es/bioweb

 



NEWS / NOTICIAS

2017. Diario16. 13/08/2017
Antibióticos, ¿peor el remedio que la enfermedad? La clave: el desarrollo de nuevos antibióticos.
El Grupo de Microbiología Molecular dirigido por el doctor Jesús Mingorance, conjuntamente con la empresa Biomol-Informatics, y los laboratorios liderados por el Dr. Paulino Gómez-Puertas del Centro de Biología Molecular del CSIC y el Dr. Miguel Vicente del Centro Nacional de Biotecnología del CSIC, han diseñado tres compuestos dirigidos contra una proteína implicada en la división de las bacterias. Con este hallazgo se abre la vía para el diseño y desarrollo de nuevas moléculas antimicrobianas. http://diario16.com/antibioticos-peor-remedio-la-enfermedad/   [Download / Descargar - PDF]

2017. El laboratorio de JAL. 30 Jun. 2017
El importante control de la división celular.
El conocido como "anillo de cohesina" es un complejo protéico con forma de anillo, como su nombre indica, que tiene la capacidad de atrapar moléculas de ADN. Fallos en las proteínas del anillo tienen implicaciones en cáncer y en una serie de enfermedades raras.

http://www.rtve.es/alacarta/audios/el-laboratorio-de-jal/laboratorio-jal-importante-control-division-celular-30-06-17/4090142/   [Download / Descargar - MP3]

2017. Diario Médico. José Antonio Plaza Ramos. 26 Jun. 2017
Sobre la calidad de las publicaciones científicas.
Entrevista a varios científicos, entre ellos a Paulino Gómez-Puertas, en la que se analiza el entorno de las publicaciones científicas.

http://www.diariomedico.com/2017/06/26/area-profesional/sanidad/se-publica-mal-y-demasiado-la-calidad-en-tela-de-juicio   [Download / Descargar - PDF]

2017. BLOG mi+d Bio(Ciencia+Tecnología), JAL. BLOG del día 18 Jun. 2017
El importante control de la división celular.
Un grupo multidisciplinar de científicos pertenecientes al Centro de Biología Molecular “Severo Ochoa” (CSIC-UAM), al Instituto de Física de la Materia Condensada de la Universidad Autónoma de Madrid y a la Facultad de Medicina de la Universidad de Zaragoza, coordinados por Paulino Gómez-Puertas, científico del CSIC, ha publicado en Scientific Reports el análisis, por primera vez a nivel atómico y utilizando sistemas avanzados de simulación computacional, del proceso de apertura del denominado “anillo de cohesina”...

http://www.madrimasd.org/blogs/biocienciatecnologia/2017/06/18/133747

2017. Marca España. RNE - Radio Exterior.
¿Para qué sirven nuestros genes? - 12/06/17

La secuencia del genoma humano fue el gran proyecto mundial del principio del nuevo milenio. Lo que un día marcó un hito, hoy es algo habitual: descifrar la composición molecular de nuestros genes conociendo, como si fuera un libro, el orden de todas sus letras. Secuenciar el genoma de una persona es algo que hoy podemos conseguir con un precio no excesivamente caro y en pocas semanas. ¿Para qué sirve? ¿Qué información dan nuestros genes? De todo eso hablamos en “A Ciencia Cierta” con Paulino Gómez-Puertas, investigador del CSIC y asesor científico de la empresa biotecnológica Genoma4u.

http://www.rtve.es/alacarta/audios/marca-espana/marca-espana-para-sirven-nuestros-genes-12-06-17/4061519/   [Download / Descargar - MP3]

2017. CSIC-comunicación.
Descubren el funcionamiento de un complejo de proteínas implicadas en casos de cáncer y enfermedades raras.
Los científicos han analizado el proceso de apertura y cierre que permite a un anillo de proteínas atrapar y soltar moléculas de ADN. El estudio se publica en la revista ‘Scientific Reports’.

Nota de prensa (PDF) [Descargar]

2017. Museo Nacional de Ciencia y Tecnología MUNCYT.
Ciencia en primera persona: ¿Para qué sirve mi genoma?. 11-Jun-2017
Paulino Gómez-Puertas, Científico Titular del Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC), que desde 2002 dirige el Grupo de Modelado Molecular del Centro de Biología Molecular "Severo Ochoa" nos planteará de forma asequible cuestiones como como las siguientes: ¿Puedo tener en mi ordenador la secuencia de mi genoma? ¿Qué información me ofrece? ¿Cambia mi genoma a lo largo de la vida? ¿Para qué me sirve? ¿Para qué le sirve a la humanidad? Para responderlas se utilizarán ejemplos reales y casos prácticos desde la experiencia de trabajo en un laboratorio de biología teórica.

Agenda MUNCYT Junio 2017 - PDF [Descargar]

2017. Europa press. Cienciaplus.
Científicos españoles logran simular a nivel atómico la reacción fotoquímica más frecuente en el ADN - 28/02/17

Un equipo internacional de científicos liderado desde la Universidad Autónoma de Madrid (UAM) ha logrado simular a nivel atómico la reacción fotoquímica más frecuente en el ADN. Los resultados revelan el importante papel del entorno biológico en la fotoestabilidad del ADN.

http://www.europapress.es/ciencia/noticia-cientificos-espanoles-logran-simular-nivel-atomico-reaccion-fotoquimica-mas-frecuente-adn-20170227115014.html  

2016. Innovaspain. Biotech.
Un ordenador y simulaciones virtuales para luchar contra enfermedades raras - 02/12/16

Avanzar en el tratamiento de algunas enfermedades genéticas, en especial las consideradas raras, es el objetivo de muchos equipos de investigación. También es el caso del grupo liderado por Paulino Gómez-Puertas en el Centro de Biología Molecular Severo Ochoa (CBMSO). Sin embargo, en este caso el método se basa en las simulaciones que realizan a través del ordenador.

http://www.innovaspain.com/ordenador-simulaciones-virtuales-luchar-enfermedades-raras/  

2016. Tecnología. El Confidencial.
Los científicos españoles que combaten enfermedades raras con un superordenador - 21/11/16

Un grupo de investigadores del Centro de Biología Molecular Severo Ochoa realiza simulaciones que ayudan a avanzar en el conocimiento y tratamiento de enfermedades raras.

http://www.elconfidencial.com/tecnologia/2016-11-21/los-cientificos-espanoles-que-combaten-enfermedades-raras-con-un-superordenador_1292161/  

2016. Tendencias 21.
Entrevista: Paulino Gómez Puertas: Cada vez sabemos más sobre enfermedades raras - 15/03/16

Mediante una muestra de saliva, el paciente puede saber si posee una enfermedad genética. Es mejor pasarse por exceso de precaución que por falta de ella, señala el doctor en biología molecular, Paulino Gómez Puertas. Añade que cerca del 80% de las enfermedades raras son de origen genético.

http://www.tendencias21.net/Paulino-Gomez-Puertas-Cada-vez-sabemos-mas-sobre-enfermedades-raras_a42241.html  

YouTube: [https://www.youtube.com/watch?v=tbrQRctEqB0]

2016. El País Semanal.
Los revolucionarios de la biotecnología. - 16/10/16

Pese a los recortes económicos y la pasividad institucional, un puñado de especialistas ha convertido a este sector en una industria de proyección internacional. Son investigadores y empresarios que buscan fórmulas para mejorar la salud y la alimentación. Representan una de las caras menos conocidas del país.

http://elpaissemanal.elpais.com/documentos/la-biotecnologia-en-espana/  

2013. Entre probetas. RNE - Radio 5. Presentado por José Antonio López, JAL.
Nobel a un mundo imaginario muy real - 07/11/13

Los investigadores Martin Karplus (Universidades de Harvard, USA, y Estrasburgo, Francia), Michael Levitt (Universidad de Stanford) y Arieh Warshel (Universidad de Southern California, USA) han sido galardonados este año con el Premio Nobel de Química por sus aportaciones a la ciencia a través de un trabajo con grandes implicaciones en el mundo de la biomedicina y en el descubrimiento y mejoras de nuevos fármacos. Y todo ello sin tocar ni un tubo de ensayo...

http://www.rtve.es/alacarta/audios/entre-probetas/entre-probetas-nobel-mundo-imaginario-muy-real-07-11-13/2126561/  [Download / Descargar - MP3]

2013. BLOG "Microbichitos" de Miguel Vicente en El Pais. 15/10/2013
Comentario conjunto firmado por Jesús Mendieta y Paulino Gómez-Puertas (Molecular Modelling Group - CBMSO), junto con Miguel Vicente (CNB) en el blog "Microbichitos" de El Pais. En el comentario se explica en qué consiste el trabajo de los tres galardonados con el Premio Nobel de Química de 2013 (Martin Karplus, Michael Levitt y Arieh Warshel) y cómo el trabajo del Molecular Modelling Group está en deuda con el suyo en el desarrollo de nuevos sistemas de simulación computacional mediante interfaz Mecánica Cuántica/Mecánica Molecular (Quantum Mechanics / Molecular Mechanics, QM/MM) y su uso para el diseño de nuevos fármacos.

http://blogs.elpais.com/microbichitos/2013/10/juegos-de-química-que-obtienen-el-nobel-.html

2013. ENTREVISTA. A Hombros de Gigantes. RNE-Radio 1. Presentado por Manuel Seara Valero. 16/09/2013
Desde las primeras investigaciones, hace más de 50 años, la informática se ha convertido en una aliada extarordinaria en la búsqueda de nuevos tratamientos para las enfermedades... El diseño de fármacos asistido por ordenador intenta descubrir nuevas moléculas activas, mejorar las ya existentes y seleccionar a partir de distintos tipos de estructuras los candidatos con mayor o menor probabilidad de convertirse en medicamentos de éxito... De este asunto, y de pruebas genéticas para la detección de efermedades, hemos hablado con Paulino Gómez Puertas, investigador del Centro de Biología Molecular Severo Ochoa y fundador de la Spin-Off "Biomol-Informatics".

http://www.rtve.es/alacarta/audios/a-hombros-de-gigantes/programa-281-diseno-farmacos-ordenador-16-09-2013/2020654/  [Download / Descargar - MP3 (50MB)]

2013. CSIC-comunicación.
Un nuevo sistema revela cómo son las proteínas en el momento exacto de su actividad química.
Mediante sistemas de análisis y virtualización de datos, un grupo de bioinformáticos, biólogos y físicos ha construido un sistema que permite conocer cómo son las proteínas en el momento exacto de su actividad química. El método, que utiliza técnicas físicas de mecánica cuántica y que ha sido liderado por investigadores del Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC) en colaboración con la empresa de base tecnológica Biomol-Informatics, aparece publicado en la revista Biochemistry.
CSIC-comunicación

Nota de prensa (pdf 116kb) [Descargar]

2013. Entre probetas. RNE - Radio 5. Presentado por José Antonio López, JAL.
Diseño inteligente de fármacos - 08/02/13

Las proteínas participan en multitud de procesos ligados a la salud y a la enfermedad. El diseño inteligente de fármacos necesita conocer la estructura de las proteínas en detalle atómico para poder ajustar de forma exacta los nuevos compuestos químicos que se constituirán en medicamentos...

http://www.rtve.es/alacarta/audios/entre-probetas/entre-probetas-diseno-inteligente-farmacos-08-02-13/1685702/  [Download / Descargar - MP3]

2013. A Hombros de Gigantes. RNE-Radio 1. Presentado por Manuel Seara Valero. 28/01/2013
Amplio reportaje sobre el Centro de Biología Molecular Severo Ochoa, elaborado por Alda Ólafsson, de prensa del CSIC, con testimonios de su director, Santiago Lamas, y de los investigadores Paola Bovolenta y Paulino Gómez-Puertas.

http://www.rtve.es/alacarta/audios/a-hombros-de-gigantes/hombros-gigantes-segunda-hora-del-programa-28-01-2013/1676573/  [Download / Descargar - MP3 (10MB)]

2013. BLOG mi+d Bio(Ciencia+Tecnología), JAL. BLOG del día 27 Ene. 2013
Diseño inteligente de fármacos y bases moleculares de linfomas. Dos nuevos ejemplos de investigación en el CBMSO.
Mediante sistemas de análisis y virtualización de datos, un grupos de científicos españoles compuesto por bioinformáticos, biólogos y físicos, pertenecientes al Centro de Biología Molecular “Severo Ochoa” (CSIC-UAM) y a la empresa de base tecnológica “Biomol-Informatics” trabaja en la simulación con detalles hasta ahora desconocidos en el mecanismo íntimo de enzimas de gran importancia en salud y enfermedad...
http://www.madrimasd.org/blogs/biocienciatecnologia/2013/01/27/132634

2012. Entre probetas. RNE - Radio 5. Presentado por José Antonio López, JAL.
La secuencia de la neumonía - 14/12/2012

Un equipo de investigadores españoles publica la secuencia completa del genoma de una variedad resistente a los antibióticos de la bacteria Klebsiella pneumoniae, causa frecuente de infecciones hospitalarias.

http://www.rtve.es/alacarta/audios/entre-probetas/entre-probetas-secuencia-neumonia-14-12-12/1612608/  [Download / Descargar - MP3]

2012. Diario Médico.
Secuenciada la nueva cepa de 'K. pneumoniae'.
Un equipo del Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC) ha obtenido la secuencia completa de una nueva cepa de la bacteria Klebsiella pneumoniae, que ha generado resistencia a la mayoría de los antibióticos de uso común. El trabajo, realizado en colaboración con investigadores del Hospital La Paz, de Madrid, de la compañía Biomol-Informatics y del Parque Científico de Madrid, se publica en el último número de The Journal of Bacteriology...
http://www.diariomedico.com/2012/12/04/area-cientifica/especialidades/genetica/secuenciada-nueva-cepa-de-k-pneumoniae  [Download / Descargar - PDF]

2012. Público.es
Secuenciado el genoma completo de una bacteria resistente a los antibióticos.
El trabajo que descodifica la nueva cepa de 'Klebsiella pneumoniae' es el primer paso para el control de bacterias multirresistentes, que se han extendido por toda Europa. Un equipo integrado por investigadores del Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC) ha obtenido la secuencia completa de una nueva cepa de la bacteria Klebsiella pneumoniae, resistente a la mayoría de los antibióticos de uso común. http://www.publico.es/ciencias/446850/secuenciado-el-genoma-completo-de-una-bacteria-resistente-a-los-antibioticos

2012. Europa Press.
Secuencian el genoma completo de una bacteria resistente a antibióticos.
Un equipo del Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC), en colaboración con científicos del Hospital La Paz de Madrid, la compañía Biomol-Informatics y el Parque Científico de Madrid, ha conseguido la secuenciación completa de una nueva cepa de la bacteria 'Klebsiella pneumoniae', resistente a la mayoría de antibióticos de uso común.
http://www.europapress.es/salud/noticia-cientificos-espanoles-secuencian-genoma-completo-bacteria-resistente-antibioticos-20121204114330.html

2012. CSIC-comunicación.
Secuenciado el genoma completo de una bacteria resistente a los antibióticos.
Un equipo integrado por investigadores del Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC) ha obtenido la secuencia completa de una nueva cepa de la bacteria Klebsiella pneumoniae, resistente a la mayoría de los antibióticos de uso común. El trabajo, realizado en colaboración con científicos del Hospital La Paz de Madrid, la compañía Biomol-Informatics y el Parque Científico de Madrid, aparece publicado en el último número de la revista Journal of Bacteriology.
CSIC-comunicación

2012. BLOG mi+d Bio(Ciencia+Tecnología), JAL. BLOG del día 13 Nov. 2012
Secuencia completa de una cepa de la bacteria Klebsiella pneumoniae resistente a los antibióticos.
La aparición de bacterias resistentes a muchos de los antibióticos conocidos es cada vez más frecuente en hospitales de todo el mundo. La tecnología de secuenciación masiva de genoma completo que permite la precisa identificación de dichas bacterias es el primer paso hacia su control. Se ha obtenido la secuencia de una nueva cepa (bautizada como KpO3210) de la bacteria Klebsiella pneumoniae...
http://www.madrimasd.org/blogs/biocienciatecnologia/2012/11/12/132576

2012. Curso de Bioinformática impartido en el CITA - Zaragoza. 7-11 Mayo 2012.
Los contenidos del curso se centran en análisis de secuencias de DNA y proteínas, análisis de genes y genomas, diseño molecular 3D de proteínas y análisis de interacciones proteían-proteína y proteína-ligando.

http://www.cita-aragon.es/index.php/mod.noticias/mem.detalle/idnoticia.370/chk.53d8a333700459d0052ed4b777ac7239.html

2012. Entre probetas. RNE - Radio 5. Presentado por José Antonio López, JAL.
Entrada viral en célula - 16/04/2012

Los miembros de la familia paramixovirus son responsables de diferentes enfermedades humanas, como el sarampión, las paperas o distintas clases de neumonía. La entrada de material genético del virus en la célula necesita de la fusión de la membrana viral con la celular, un proceso mediado por la proteína F del virus.

http://www.rtve.es/alacarta/audios/entre-probetas/entre-probetas-entrada-viral-celula-16-04-12/1377172/  [Download / Descargar - MP3]

2012. Europa Press.
Investigadores del CSIC revelan el comportamiento de una región implicada en la multiplicación de bacterias.
Según han explicado los investigadores, el hallazgo puede ser utilizado en el desarrollo de nuevos antibióticos. La investigación, dirigida por Paulino Gómez-Puertas del Centro de Biología Molecular Severo Ochoa, ha contado con la colaboración de investigadores del Centro Nacional de Biotecnología del CSIC, el Hospital Universitario La Paz y la compañía Biomol-Informatics....
http://www.europapress.es/salud/noticia-revelan-comportamiento-region-implicada-multiplicacion-bacterias-20120330145249.html

2012. CSIC-comunicación.
Avanza la lucha contra las infecciones bacterianas.
El estudio con participación del CSIC contribuirá al desarrollo de nuevos fármacos. Una investigación dirigida por el Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC) ha logrado describir el comportamiento de un filamento de la proteína FtsZ. Esta molécula es la base de la estructura a partir de la cual una bacteria inicia su proceso de división y se multiplica...
CSIC-comunicación
[CSIC COVER / CSIC PORTADA 30-MAR-2012]
Nota de prensa (pdf 82kb) [Descargar]

2012. BLOG mi+d Bio(Ciencia+Tecnología), JAL.
Los primeros pasos de la unión de un virus a la membrana celular.
Los miembros de la familia de virus “paramixovirus” son responsables de diferentes enfermedades humanas, como el sarampión, las paperas o distintas clases de neumonía (virus respitatorio sincitial y virus de la parainfluenza). Un grupo multidisciplinar de científicos compuesto por biólogos, biotecnólogos y físicos, pertenecientes al Centro de Biología Molecular “Severo Ochoa” (CBMSO, CSIC-UAM) y a la empresa de base tecnológica “Biomol-Informatics”, ha descrito por primera vez un posible mecanismo...
http://www.madrimasd.org/blogs/biocienciatecnologia/2012/03/23/132253

2012. Entre probetas. RNE - Radio 5. Presentado por José Antonio López, JAL.
Oncogen Ras y cáncer - 13/03/2012

La proteína del oncogén Ras humano está implicada en un gran número de tumores malignos relacionándose a menudo con la aparición de metástasis.El estudio detallado de su funcionamiento puede abrir la clave para su su regulación farmacológica, mediante el diseño racional de fármacos.

http://www.rtve.es/alacarta/audios/entre-probetas/entre-probetas---oncogen-ras-cancer---13-02-12/1347696/

2012. BLOG mi+d Bio(Ciencia+Tecnología), JAL.
El oncogén Ras y su implicación en cáncer.
Un grupo multidisciplinar de científicos españoles compuesto por biólogos, biotecnólogos y físicos, pertenecientes al Centro de Biología Molecular Severo Ochoa (CSIC-UAM) y a la empresa de base tecnológica “Biomol-Informatics”, ha descrito por primera vez el mecanismo de acción de la proteína Ras humana con detalle atómico....

http://www.madrimasd.org/blogs/biocienciatecnologia/2012/02/11/132207

2011. La simulación computacional disminuirá en el futuro los experimentos reales en laboratorio. Un experto del CSIC explica en Salamanca los avances en diseño de fármacos mediante simulación por ordenador y otras aplicaciones de la Bioinformática...

http://www.dicyt.com/noticias/la-simulacion-computacional-disminuira-en-el-futuro-los-experimentos-reales-en-laboratorio
http://www.salamanca24horas.com/local/55192-la-simulacion-computacional-disminuira-en-el-futuro-los-experimentos-reales-en-laboratorio

2011. Game on! learning to fight real diseases in a virtual world. In the Madrid laboratory of Dr Paulino Gómez-Puertas, they are creating a virtual world using computer simulation to design artificial drugs that can help to cure diseases in the real world...

http://sociedad.elpais.com/sociedad/2011/09/15/actualidad/1316037622_850215.html

2011. Game on! Im Labor von Dr. Paulino Gómez-Puertas in Madrid erbauen Wissenschaftler eine virtuellen Welt. So sollen Modelle von Medikamenten entstehen, die in Zukunft ganz reale Krankheiten heilen. Von Paulino Gomez-Puertas, Universidad Autonoma de Madrid.

http://www.faz.net/aktuell/wissen/atomium-culture/medizinische-forschung-game-on-11188226.html

2009.
Conclusiones del 'Proyecto Combact' - Europa Press (in spanish)
Un total de quince grupos de investigación de la Comunidad de Madrid han participado durante cuatro años en el proyecto de investigación Combact que tiene como objetivo prioritario encontrar nuevas formas de combatir las bacterias resistentes a los antibióticos.

http://www.europapress.es/videos/video-conclusiones-proyecto-combact-20101019094923.html

2009.
FP7 PROJECT: DIVINOCELL - INVERVIEW Europa Press (in spanish)
PROYECTO FP7: DIVINOCELL - ENTREVISTA Europa Press.

http://www.europapress.es/videos/video-proyecto-divinocell-contra-bacterias-20090319152556.html



BIOWEB: MOLECULAR MODELLING GROUP
Centro de Biología Molecular "Severo Ochoa" (CSIC-UAM).
http://www.cbm.csic.es/bioweb
C/ Nicolás Cabrera, 1. Campus UAM, Cantoblanco.
28049 Madrid. Spain
Tel: (+34) 91 196 4662 / 4663
Fax: (+34) 91 196 4420
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