bioweb: molecular modeling group / grupo de modelado molecular

[ http://bioweb.cbm.uam.es ]  [ http://www.cbm.csic.es/bioweb ]

 



NEWS / NOTICIAS

2024. 23/10/2024
NCYT. Noticias de la Ciencia y la Tecnología. Medicina.


Diseñan péptidos contra las nuevas variantes del virus de la COVID-19. Se ha conseguido diseñar computacionalmente unas moléculas con la capacidad de neutralizar in vitro las últimas subvariantes del SARS-CoV-2, el coronavirus culpable de la pandemia de COVID-19. El trabajo es fruto de la colaboración entre científicos del grupo de Paulino Gómez-Puertas, del Centro de Biología Molecular Severo Ochoa (CBM), entidad mixta del Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC) y la Universidad Autónoma de Madrid (UAM), en España; y del de César Ramírez-Segura, del Instituto Distrital de Ciencia, Biotecnología e Innovación en Salud (IDCBIS) en Bogotá, Colombia.

[https://noticiasdelaciencia.com/art/52374/disenan-peptidos-contra-las-nuevas-variantes-del-virus-de-la-covid-19]

2024. 21/10/2024
Gaceta Médica. Investigación.


Nuevas moléculas neutralizan variantes del SARS-CoV-2 y prometen combatir futuras cepas. En un avance prometedor en la lucha contra las variantes emergentes del SARS-CoV-2, investigadores del Centro de Biología Molecular Severo Ochoa (CBM-CSIC-UAM) y del Instituto Distrital de Ciencia, Biotecnología e Innovación en Salud (IDCBIS) han desarrollado moléculas con potencial neutralizante contra las nuevas variantes del virus. Este innovador enfoque, basado en el diseño computacional, abre una puerta a futuras terapias más efectivas no solo para el SARS-CoV-2, sino también para otros coronavirus de la familia de los Sarbecovirus.

[https://gacetamedica.com/investigacion/nuevas-moleculas-neutralizan-variantes-del-sars-cov-2-y-prometen-combatir-futuras-cepas/]

2024. 17/10/2024
CBM Severo Ochoa. Ciencia y sociedad. Noticias.


Investigadores del CBM generan moléculas con actividad neutralizante frente a las nuevas variantes del virus SARS-CoV-2 utilizando el diseño computacional. Las moléculas, un tipo de péptidos pequeños llamados miniACE2, han sido diseñados computacionalmente por el Centro de Biología Molecular y el IDCBIS para engañar al sistema de entrada en las células del virus SARS-CoV-2. Tras sintetizarlos en el laboratorio, se ha demostrado su efectividad frente a las variantes circulantes de SARS-CoV-2 en ensayos ‘in vitro’

[https://www.cbm.uam.es/index.php/2024/10/17/investigadores-generan-moleculas-con-actividad-neutralizante-frente-a-las-nuevas-variantes-del-virus-sars-cov-2-utilizando-el-diseno-computacional/]

2024. 17/10/2024
CSIC. Actualidad del CSIC. Nota de prensa.


Investigadores generan moléculas con actividad neutralizante frente a las nuevas variantes del virus SARS-CoV-2 utilizando el diseño computacional. Las moléculas, un tipo de péptidos pequeños llamados miniACE2, han sido diseñados computacionalmente por el Centro de Biología Molecular y el IDCBIS para engañar al sistema de entrada en las células del virus SARS-CoV-2.

[https://www.csic.es/es/actualidad-del-csic/investigadores-generan-moleculas-con-actividad-neutralizante-frente-las-nuevas-variantes-del-virus-sars-cov-2-utilizando-el-diseno-computacional-0]

2024. 02/08/2024
NCYT. Noticias de la Ciencia y la Tecnología. Bioquímica.


Posible mecanismo molecular de control de la formación de lazos en el ADN. Usando herramientas de simulación computacional, el grupo de Modelado Molecular del Centro de Biología Molecular Severo Ochoa (CBM), dependiente del Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC) y de la Universidad Autónoma de Madrid (UAM), en España, ha propuesto por primera vez, como sistema de control del proceso, un mecanismo de trinquete, con la implicación de las proteínas STAG2 y RAD21.

[https://noticiasdelaciencia.com/art/51517/posible-mecanismo-molecular-de-control-de-la-formacion-de-lazos-en-el-adn]

2024. 25/07/2024
Diario Salud. República Dominicana.


Proponen mecanismo molecular para controlar formación de lazos en ADN. Un equipo del Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC) ha descrito un innovador mecanismo para controlar la formación de lazos de ADN por las proteínas cohesinas, implicadas en procesos cancerígenos y en enfermedades raras. Este avance podría abrir nuevas vías para el desarrollo de tratamientos médicos.

[https://www.diariosalud.do/noticias/proponen-mecanismo-molecular-para-controlar-formacion-de-lazos-en-adn/]

2024. 24/07/2024
Infosalus (Europa Press)


Proponen un mecanismo molecular que abre la puerta a una nueva diana contra el cáncer y enfermedades raras. Un equipo del Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC) ha descrito un mecanismo para controlar la formación de lazos de ADN por las proteínas llamadas cohesinas, implicadas en procesos cancerígenos y en enfermedades raras, lo que podría suponer una nueva diana de medicamentos contra estas enfermedades.

[https://www.infosalus.com/salud-investigacion/noticia-proponen-mecanismo-molecular-abre-puerta-nueva-diana-contra-cancer-enfermedades-raras-20240724150748.html]

2024. 24/07/2024
CSIC Comunicación


Proponen un mecanismo molecular para controlar la formación de lazos en el ADN. Un equipo del CSIC describe un mecanismo para controlar la formación de lazos de ADN por las proteínas llamadas cohesinas, implicadas en procesos cancerígenos y en enfermedades raras.

[https://www.csic.es/es/actualidad-del-csic/proponen-un-mecanismo-molecular-para-controlar-la-formacion-de-lazos-en-el-adn] PDF: [NdP24julio2024_Lazos_ADN.pdf]

Facebook: [https://www.facebook.com/photo/?fbid=878823967608943&set=a.576832084474801&locale=es_ES]

X: [https://x.com/CSIC/status/1816022918259777745]


2024. 24/07/2024
UAM Cultura Científica


Proponen un mecanismo molecular para el control de la formación de lazos en el ADN, clave para la división celular. Usando herramientas de simulación computacional, el grupo de Modelado Molecular del Centro de Biología Molecular Severo Ochoa (CSIC-UAM) ha propuesto por primera vez un mecanismo de trinquete, implicando a las proteínas STAG2 y RAD21. Este mecanismo permite el alargamiento unidireccional de los lazos de ADN, bloqueando al mismo tiempo el retroceso y, por tanto, el acortamiento de estos lazos.

[https://www.uam.es/uam/investigacion/cultura-cientifica/noticias/mecanismo-molecular-adn]


2024. 03/01/2024
Infosalus (Europa Press)


Expertos recalcan que el desarrollo de nuevos fármacos para el sarcoma es "una necesidad no satisfecha". El Hospital Universitario Fundación Jiménez Díaz celebró recientemente su segundo Taller sobre Enfoques Innovadores en Sarcoma, centrado en el desarrollo de fármacos específicos y con la participación de más de 160 especialistas inscritos. Entre otros ponentes, participó Paulino Gómez-Puertas, con una conferencia sobre acoplamiento in silico con modelado dinámico.

[https://www.infosalus.com/farmacia/noticia-expertos-recalcan-desarrollo-nuevos-farmacos-sarcoma-necesidad-no-satisfecha-20240103150616.html]

2023. 19/12/2023
Radio "Enfermedades Raras"


Simulación computacional de enfermedades raras. En el programa de radio científico "Enfermedades Raras" número 402, presentado y dirigido por Antonio G. Armas, se entrevista al Dr. Paulino Gómez-Puertas sobre simulación computacional de enfermededes raras, modelado molecular, Síndrome de Cornelia de Lange, etc.

[https://www.radioenfermedadesraras.com/podcast/simulacion-computacional-de-enfermedades-raras-ref100096853.html]

2023. 22/03/2023
BBVA - noticias


Machine learning y cuántica para crear nuevos medicamentos. Estudiar nuevos fármacos y sus propiedades es más asequible con superordenadores e inteligencia artificial. Y en el futuro nos espera la computación cuántica. Según los expertos, la IA ha democratizado el desarrollo de medicamentos y ayuda a comprender la química y a cuestionar algunos marcos de trabajo.

[https://www.bbva.ch/noticia/machine-learning-y-cuantica-para-crear-nuevos-medicamentos/]

2022. 06/05/2022
El Tiempo - Colombia


Diseñan proteína en Bogotá para contrarrestar los efectos del Sars-CoV-2. El Instituto Distrital de Ciencia, Biotecnología e Innovación en Salud (IDCBIS) en colaboración con el Instituto de Errores Innatos del Metabolismo de la Universidad Javeriana (IEIM) y el Laboratorio de Modelado Molecular del Centro de Biología Molecular Severo Ochoa de España (CBM), ha logrado desarrollar tres modelos de proteínas que buscan neutralizar el virus Sars-CoV-2 y, por tanto, contrarrestar el impacto de la enfermedad en las personas contagiadas. En el proyecto, participaron los investigadores Cesar Augusto Ramírez (IDCBIS) y Paulino Gómez Puertas del Laboratorio de Modelado Molecular (CBM).

[https://www.eltiempo.com/salud/disenan-proteina-en-bogota-para-contrarrestar-los-efectos-del-sars-cov-2-670384]

2021. 08/03/2021
CBM Facebook


JPIAMR Network Plus 2020 - Alliance for the Exploration of Pipelines for Inhibitors of Carbapenemases (EPIC Alliance) Inicio de la red europea "JPIAMR Network Plus 2020 Alliance for the Exploration of Pipelines for Inhibitors of Carbapenemases (EPIC Alliance)" para el diseño de nuevos antibióticos, en la que participa el CBM. [https://www.jpiamr.eu/aepic/]

Facebook: [CBM Facebook]

2021. 08/03/2021
Comunidad de Madrid


JPIAMR Network Plus 2020 - Alliance for the Exploration of Pipelines for Inhibitors of Carbapenemases (EPIC Alliance) El Hospital Universitario La Paz-IdiPAZ coordina la red europea EPIC Alliance para la Exploración de nuevos procedimientos en la búsqueda de inhibidores de carbapenemasas, enzimas producidas por algunas bacterias que son resistentes a los antibióticos de la familia de los betalactámicos. Este proyecto ha sido promovido por la JPIAMR Network Plus 2020 y financiado por el Instituto de Salud Carlos III. La red, formada por 11 miembros de siete países diferentes, está coordinada por el Dr. Elias Dahdouh, del Instituto de Investigación Sanitaria del Hospital Universitario La Paz (IdiPAZ), y participan en ella el Grupo de Microbiología Molecular de IdiPAZ y el Servicio de Microbiología del hospital madrileño.

https://www.comunidad.madrid/noticias/2021/03/08/paz-idipaz-coordina-red-europea-luchar-resistencias-bacterianas-antibioticos

2021. 08/03/2021
EPIC Alliance has launched / La Alianza EPIC se ha puesto en marcha


JPIAMR Network Plus 2020 - Alliance for the Exploration of Pipelines for Inhibitors of Carbapenemases (EPIC Alliance) EPIC Alliance has launched! The consortium that was awarded funding under the JPIAMR Network Plus 2020 and the Instituto de Salud Carlos III transnational calls officially convened and held its launch meeting on the 29th of January, 2021. The founder consortium is composed of 11 members and from 7 countries. [www.jpiamr.eu/aepic]

JPIAMR Network Plus 2020 - Alianza para la exploración de procedimientos en la búsqueda de inhibidores de carbapenemasas (Alianza EPIC) ¡La Alianza EPIC se ha puesto en marcha! El consorcio, financiado en el marco de la Red JPIAMR Plus 2020 y de las convocatorias transnacionales del Instituto de Salud Carlos III se reunió oficialmente y celebró su reunión inicial el 29 de enero de 2021. Este consorcio está compuesto por 11 miembros de 7 países. [www.jpiamr.eu/aepic]

Read the press release / Lee la nota de prensa


2020. 19/03/2020
Expansión. Economía digital.


Superordenadores en la lucha contra el Covid-19 La enorme capacidad de cómputo de estos equipos permite a los investigadores acelerar la búsqueda de fármacos contra el virus y abordar complejos estudios de genoma para entender mejor la enfermedad. La investigación farmacológica sería imposible sin el poder de la supercomputación. Y ahora, cuando se trabaja contra el crono, estos grandes ordenadores se han convertido en un aliado indispensable de los científicos. "Podemos probar en el superordenador millones de fármacos virtuales para ver si son candidatos a un tratamiento futuro de la enfermedad", explica Paulino Gómez-Puertas, científico del Severo Ochoa.

https://www.expansion.com/economia-digital/innovacion/2020/03/21/5e73a83ce5fdead7218b4597.html

Descarga la noticia en PDF: Expansion_19-Mar-2020.pdf

2019. 21/05/2019
IBM case-studies.


Collaboration CBM-IBM: Harnessing technology to fight genetic disorders for humanity’s greater good. Computer modeling of protein interactions can offer deep insight into human biology—but requires immense processing power. The Centro de Biología Molecular Severo Ochoa is harnessing the huge performance, scalability and capacity of IBM® Power Systems™ servers to help find a treatment for the rare genetic disorder Cornelia de Lange syndrome (CdLS).

https://www.ibm.com/case-studies/CBM-systems-hardware-power-research

Download a PDF brochure of the case-study here (English): https://ibm.co/2OALb9O

Descargue un folleto en PDF del caso-de-estudio aquí (Castellano): https://ibm.co/2YGtwx4

2019. 27/03/2019
RNE-Radio Exterior. Marca España - A Ciencia Cierta.


Superordenadores y diseño de fármacos. Los superordenadores han abierto nuevas oportunidades de investigación a los científicos, ya que permiten simular de una manera casi exacta como funciona una célula o un organismo, de tal forma que permiten investigar sin tener que recurrir a modelos animales. Estos superordenadores se utilizan por ejemplo para investigar una enfermedad muy rara, como el Síndrome de Cornelia de Lange, y diseñar fármacos frente a ella. En eso trabaja Paulino Gómez Puertas, director del grupo de Modelado Molecular del CBM, a quien entrevistamos en la sección “A Ciencia Cierta”.

http://www.rtve.es/alacarta/audios/marca-espana/marca-espana-superordenadores-diseno-farmacos-27-03-19/5096979/   [Download / Descargar - MP3]

2019. 24/03/2019
RNE-Radio5. El laboratorio de JAL.


Superordenadores en el diseño de nuevos fármacos. En el laboratorio de Modelado Molecular del Centro de Biología Molecular Severo Ochoa se ha iniciado una colaboración con el objetivo de obtener un nuevo sistema de desarrollo de fármacos más fiable y rápido, en un entorno de simulación virtual.

http://www.rtve.es/alacarta/audios/el-laboratorio-de-jal/laboratorio-jal-superordenadores-diseno-nuevos-farmacos-24-03-19/5087924/   [Download / Descargar - MP3]

2019. 08/03/2019
BLOG mi+d Bio(Ciencia+Tecnología), José Antonio López, JAL.


Superordenadores en el diseño de nuevos fármacos. En el laboratorio de Modelado Molecular del Centro de Biología Molecular Severo Ochoa (CBM) se ha iniciado una colaboración con una veterana empresa informática madrileña, Repessa, que es socio tecnológico del gigante de la computación IBM. El objetivo de esta colaboración, financiada por la propia empresa, por la Agencia Española de Investigación y por Fondos Europeos, es obtener un nuevo sistema de desarrollo de fármacos más fiable y rápido, en un entorno de simulación virtual....

http://www.madrimasd.org/blogs/biocienciatecnologia/2019/03/08/134220

2019. 05/03/2019
Xataca ciencia


Superordenadores y nuevas tecnologías, actuales tubos de ensayo en investigación biomédica. Los métodos de diagnóstico y tratamiento se han ido perfeccionando a lo largo de siglos a través de diferentes aproximaciones con foco, sobre todo, en los fármacos. En la era de la tecnología, le toca el turno a una herramienta de laboratorio relativamente nueva, la supercomputación, que ya están probando en el Centro de Biología Molecular Severo Ochoa. Hablamos del área de biología computacional o simulación biológica.

https://www.xatakaciencia.com/n/superordenadores-nuevas-tecnologias-actuales-tubos-ensayo-investigacion-biomedica

2019. 28/02/2019
La Sexta noticias


Científicos madrileños usan una supercomputadora para luchar contra las enfermedades raras.
Los científicos investigan nuevos tratamientos contra enfermedades raras como la que padece Diana, una joven con Síndrome de Cornelia de Lange.

LINK a la noticia

2019. 28/02/2019
IBM news


El Centro de Biología Molecular Severo Ochoa acelera su investigación sobre enfermedades raras gracias a la supercomputación de IBM. Permite a los biotecnólogos simular de forma virtual el comportamiento de posibles fármacos tal como lo harían en la vida real, a una velocidad inalcanzable con técnicas de laboratorio clásicas.

https://www-03.ibm.com/press/es/es/pressrelease/54789.wss
https://www.youtube.com/watch?v=jxN2TpRvyQU

2018. 03/04/2018
CIENCIA, y yo quiero ser científico!!!


Participación del grupo en el libro de divulgación “CIENCIA, y yo quiero ser científico!!!”, coordinado por Quintín Garrido, entusiasta de la divulgación científica. El libro está dirigido a estudiantes de ESO y Bachillerato para animarles a ser científicos. Se puede descargar completo o por capítulos de forma gratuita en: https://cienciayyoquierosercientifico.blogspot.com.es/

2017. Diario16. 13/08/2017
Antibióticos, ¿peor el remedio que la enfermedad? La clave: el desarrollo de nuevos antibióticos.
El Grupo de Microbiología Molecular dirigido por el doctor Jesús Mingorance, conjuntamente con la empresa Biomol-Informatics, y los laboratorios liderados por el Dr. Paulino Gómez-Puertas del Centro de Biología Molecular del CSIC y el Dr. Miguel Vicente del Centro Nacional de Biotecnología del CSIC, han diseñado tres compuestos dirigidos contra una proteína implicada en la división de las bacterias. Con este hallazgo se abre la vía para el diseño y desarrollo de nuevas moléculas antimicrobianas. http://diario16.com/antibioticos-peor-remedio-la-enfermedad/   [Download / Descargar - PDF]

2017. El laboratorio de JAL. 30 Jun. 2017
El importante control de la división celular.
El conocido como "anillo de cohesina" es un complejo protéico con forma de anillo, como su nombre indica, que tiene la capacidad de atrapar moléculas de ADN. Fallos en las proteínas del anillo tienen implicaciones en cáncer y en una serie de enfermedades raras.

http://www.rtve.es/alacarta/audios/el-laboratorio-de-jal/laboratorio-jal-importante-control-division-celular-30-06-17/4090142/   [Download / Descargar - MP3]

2017. Diario Médico. José Antonio Plaza Ramos. 26 Jun. 2017
Sobre la calidad de las publicaciones científicas.
Entrevista a varios científicos, entre ellos a Paulino Gómez-Puertas, en la que se analiza el entorno de las publicaciones científicas.

http://www.diariomedico.com/2017/06/26/area-profesional/sanidad/se-publica-mal-y-demasiado-la-calidad-en-tela-de-juicio   [Download / Descargar - PDF]

2017. BLOG mi+d Bio(Ciencia+Tecnología), JAL. BLOG del día 18 Jun. 2017
El importante control de la división celular.
Un grupo multidisciplinar de científicos pertenecientes al Centro de Biología Molecular “Severo Ochoa” (CSIC-UAM), al Instituto de Física de la Materia Condensada de la Universidad Autónoma de Madrid y a la Facultad de Medicina de la Universidad de Zaragoza, coordinados por Paulino Gómez-Puertas, científico del CSIC, ha publicado en Scientific Reports el análisis, por primera vez a nivel atómico y utilizando sistemas avanzados de simulación computacional, del proceso de apertura del denominado “anillo de cohesina”...

http://www.madrimasd.org/blogs/biocienciatecnologia/2017/06/18/133747

2017. Marca España. RNE - Radio Exterior.
¿Para qué sirven nuestros genes? - 12/06/17

La secuencia del genoma humano fue el gran proyecto mundial del principio del nuevo milenio. Lo que un día marcó un hito, hoy es algo habitual: descifrar la composición molecular de nuestros genes conociendo, como si fuera un libro, el orden de todas sus letras. Secuenciar el genoma de una persona es algo que hoy podemos conseguir con un precio no excesivamente caro y en pocas semanas. ¿Para qué sirve? ¿Qué información dan nuestros genes? De todo eso hablamos en “A Ciencia Cierta” con Paulino Gómez-Puertas, investigador del CSIC y asesor científico de la empresa biotecnológica Genoma4u.

http://www.rtve.es/alacarta/audios/marca-espana/marca-espana-para-sirven-nuestros-genes-12-06-17/4061519/   [Download / Descargar - MP3]

2017. CSIC-comunicación.
Descubren el funcionamiento de un complejo de proteínas implicadas en casos de cáncer y enfermedades raras.
Los científicos han analizado el proceso de apertura y cierre que permite a un anillo de proteínas atrapar y soltar moléculas de ADN. El estudio se publica en la revista ‘Scientific Reports’.

Nota de prensa (PDF) [Descargar]

2017. Museo Nacional de Ciencia y Tecnología MUNCYT.
Ciencia en primera persona: ¿Para qué sirve mi genoma?. 11-Jun-2017
Paulino Gómez-Puertas, Científico Titular del Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC), que desde 2002 dirige el Grupo de Modelado Molecular del Centro de Biología Molecular Severo Ochoa nos planteará de forma asequible cuestiones como como las siguientes: ¿Puedo tener en mi ordenador la secuencia de mi genoma? ¿Qué información me ofrece? ¿Cambia mi genoma a lo largo de la vida? ¿Para qué me sirve? ¿Para qué le sirve a la humanidad? Para responderlas se utilizarán ejemplos reales y casos prácticos desde la experiencia de trabajo en un laboratorio de biología teórica.

Agenda MUNCYT Junio 2017 - PDF [Descargar]

2017. Europa press. Cienciaplus.
Científicos españoles logran simular a nivel atómico la reacción fotoquímica más frecuente en el ADN - 28/02/17

Un equipo internacional de científicos liderado desde la Universidad Autónoma de Madrid (UAM) ha logrado simular a nivel atómico la reacción fotoquímica más frecuente en el ADN. Los resultados revelan el importante papel del entorno biológico en la fotoestabilidad del ADN.

http://www.europapress.es/ciencia/noticia-cientificos-espanoles-logran-simular-nivel-atomico-reaccion-fotoquimica-mas-frecuente-adn-20170227115014.html  

2016. Innovaspain. Biotech.
Un ordenador y simulaciones virtuales para luchar contra enfermedades raras - 02/12/16

Avanzar en el tratamiento de algunas enfermedades genéticas, en especial las consideradas raras, es el objetivo de muchos equipos de investigación. También es el caso del grupo liderado por Paulino Gómez-Puertas en el Centro de Biología Molecular Severo Ochoa (CBM). Sin embargo, en este caso el método se basa en las simulaciones que realizan a través del ordenador.

http://www.innovaspain.com/ordenador-simulaciones-virtuales-luchar-enfermedades-raras/  

2016. Tecnología. El Confidencial.
Los científicos españoles que combaten enfermedades raras con un superordenador - 21/11/16

Un grupo de investigadores del Centro de Biología Molecular Severo Ochoa realiza simulaciones que ayudan a avanzar en el conocimiento y tratamiento de enfermedades raras.

http://www.elconfidencial.com/tecnologia/2016-11-21/los-cientificos-espanoles-que-combaten-enfermedades-raras-con-un-superordenador_1292161/  

2016. Tendencias 21.
Entrevista: Paulino Gómez Puertas: Cada vez sabemos más sobre enfermedades raras - 15/03/16

Mediante una muestra de saliva, el paciente puede saber si posee una enfermedad genética. Es mejor pasarse por exceso de precaución que por falta de ella, señala el doctor en biología molecular, Paulino Gómez Puertas. Añade que cerca del 80% de las enfermedades raras son de origen genético.

http://www.tendencias21.net/Paulino-Gomez-Puertas-Cada-vez-sabemos-mas-sobre-enfermedades-raras_a42241.html  

YouTube: [https://www.youtube.com/watch?v=tbrQRctEqB0]  

iVoox podcast: [https://www.ivoox.com/entrevista-paulino-gomez-puertas-audios-mp3_rf_10807761_1.html]

2016. El País Semanal.
Los revolucionarios de la biotecnología. - 16/10/16

Pese a los recortes económicos y la pasividad institucional, un puñado de especialistas ha convertido a este sector en una industria de proyección internacional. Son investigadores y empresarios que buscan fórmulas para mejorar la salud y la alimentación. Representan una de las caras menos conocidas del país.

http://elpaissemanal.elpais.com/documentos/la-biotecnologia-en-espana/  

2013. Entre probetas. RNE - Radio 5. Presentado por José Antonio López, JAL.
Nobel a un mundo imaginario muy real - 07/11/13

Los investigadores Martin Karplus (Universidades de Harvard, USA, y Estrasburgo, Francia), Michael Levitt (Universidad de Stanford) y Arieh Warshel (Universidad de Southern California, USA) han sido galardonados este año con el Premio Nobel de Química por sus aportaciones a la ciencia a través de un trabajo con grandes implicaciones en el mundo de la biomedicina y en el descubrimiento y mejoras de nuevos fármacos. Y todo ello sin tocar ni un tubo de ensayo...

http://www.rtve.es/alacarta/audios/entre-probetas/entre-probetas-nobel-mundo-imaginario-muy-real-07-11-13/2126561/  [Download / Descargar - MP3]

2013. BLOG "Microbichitos" de Miguel Vicente en El Pais. 15/10/2013
Comentario conjunto firmado por Jesús Mendieta y Paulino Gómez-Puertas (Molecular Modeling Group - CBM), junto con Miguel Vicente (CNB) en el blog "Microbichitos" de El Pais. En el comentario se explica en qué consiste el trabajo de los tres galardonados con el Premio Nobel de Química de 2013 (Martin Karplus, Michael Levitt y Arieh Warshel) y cómo el trabajo del Molecular Modeling Group está en deuda con el suyo en el desarrollo de nuevos sistemas de simulación computacional mediante interfaz Mecánica Cuántica/Mecánica Molecular (Quantum Mechanics / Molecular Mechanics, QM/MM) y su uso para el diseño de nuevos fármacos.

http://blogs.elpais.com/microbichitos/2013/10/juegos-de-química-que-obtienen-el-nobel-.html

2013. ENTREVISTA. A Hombros de Gigantes. RNE-Radio 1. Presentado por Manuel Seara Valero. 16/09/2013
Desde las primeras investigaciones, hace más de 50 años, la informática se ha convertido en una aliada extarordinaria en la búsqueda de nuevos tratamientos para las enfermedades... El diseño de fármacos asistido por ordenador intenta descubrir nuevas moléculas activas, mejorar las ya existentes y seleccionar a partir de distintos tipos de estructuras los candidatos con mayor o menor probabilidad de convertirse en medicamentos de éxito... De este asunto, y de pruebas genéticas para la detección de efermedades, hemos hablado con Paulino Gómez Puertas, investigador del Centro de Biología Molecular Severo Ochoa y fundador de la Spin-Off "Biomol-Informatics".

http://www.rtve.es/alacarta/audios/a-hombros-de-gigantes/programa-281-diseno-farmacos-ordenador-16-09-2013/2020654/  [Download / Descargar - MP3 (50MB)]

2013. CSIC-comunicación.
Un nuevo sistema revela cómo son las proteínas en el momento exacto de su actividad química.
Mediante sistemas de análisis y virtualización de datos, un grupo de bioinformáticos, biólogos y físicos ha construido un sistema que permite conocer cómo son las proteínas en el momento exacto de su actividad química. El método, que utiliza técnicas físicas de mecánica cuántica y que ha sido liderado por investigadores del Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC) en colaboración con la empresa de base tecnológica Biomol-Informatics, aparece publicado en la revista Biochemistry.
CSIC-comunicación

Nota de prensa (pdf 116kb) [Descargar]

2013. Entre probetas. RNE - Radio 5. Presentado por José Antonio López, JAL.
Diseño inteligente de fármacos - 08/02/13

Las proteínas participan en multitud de procesos ligados a la salud y a la enfermedad. El diseño inteligente de fármacos necesita conocer la estructura de las proteínas en detalle atómico para poder ajustar de forma exacta los nuevos compuestos químicos que se constituirán en medicamentos...

http://www.rtve.es/alacarta/audios/entre-probetas/entre-probetas-diseno-inteligente-farmacos-08-02-13/1685702/  [Download / Descargar - MP3]

2013. A Hombros de Gigantes. RNE-Radio 1. Presentado por Manuel Seara Valero. 28/01/2013
Amplio reportaje sobre el Centro de Biología Molecular Severo Ochoa, elaborado por Alda Ólafsson, de prensa del CSIC, con testimonios de su director, Santiago Lamas, y de los investigadores Paola Bovolenta y Paulino Gómez-Puertas.

http://www.rtve.es/alacarta/audios/a-hombros-de-gigantes/hombros-gigantes-segunda-hora-del-programa-28-01-2013/1676573/  [Download / Descargar - MP3 (10MB)]

2013. BLOG mi+d Bio(Ciencia+Tecnología), JAL. BLOG del día 27 Ene. 2013
Diseño inteligente de fármacos y bases moleculares de linfomas. Dos nuevos ejemplos de investigación en el CBM.
Mediante sistemas de análisis y virtualización de datos, un grupos de científicos españoles compuesto por bioinformáticos, biólogos y físicos, pertenecientes al Centro de Biología Molecular “Severo Ochoa” (CSIC-UAM) y a la empresa de base tecnológica “Biomol-Informatics” trabaja en la simulación con detalles hasta ahora desconocidos en el mecanismo íntimo de enzimas de gran importancia en salud y enfermedad...
http://www.madrimasd.org/blogs/biocienciatecnologia/2013/01/27/132634

2012. Entre probetas. RNE - Radio 5. Presentado por José Antonio López, JAL.
La secuencia de la neumonía - 14/12/2012

Un equipo de investigadores españoles publica la secuencia completa del genoma de una variedad resistente a los antibióticos de la bacteria Klebsiella pneumoniae, causa frecuente de infecciones hospitalarias.

http://www.rtve.es/alacarta/audios/entre-probetas/entre-probetas-secuencia-neumonia-14-12-12/1612608/  [Download / Descargar - MP3]

2012. Diario Médico.
Secuenciada la nueva cepa de 'K. pneumoniae'.
Un equipo del Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC) ha obtenido la secuencia completa de una nueva cepa de la bacteria Klebsiella pneumoniae, que ha generado resistencia a la mayoría de los antibióticos de uso común. El trabajo, realizado en colaboración con investigadores del Hospital La Paz, de Madrid, de la compañía Biomol-Informatics y del Parque Científico de Madrid, se publica en el último número de The Journal of Bacteriology...
http://www.diariomedico.com/2012/12/04/area-cientifica/especialidades/genetica/secuenciada-nueva-cepa-de-k-pneumoniae  [Download / Descargar - PDF]

2012. Público.es
Secuenciado el genoma completo de una bacteria resistente a los antibióticos.
El trabajo que descodifica la nueva cepa de 'Klebsiella pneumoniae' es el primer paso para el control de bacterias multirresistentes, que se han extendido por toda Europa. Un equipo integrado por investigadores del Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC) ha obtenido la secuencia completa de una nueva cepa de la bacteria Klebsiella pneumoniae, resistente a la mayoría de los antibióticos de uso común. http://www.publico.es/ciencias/446850/secuenciado-el-genoma-completo-de-una-bacteria-resistente-a-los-antibioticos

2012. Europa Press.
Secuencian el genoma completo de una bacteria resistente a antibióticos.
Un equipo del Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC), en colaboración con científicos del Hospital La Paz de Madrid, la compañía Biomol-Informatics y el Parque Científico de Madrid, ha conseguido la secuenciación completa de una nueva cepa de la bacteria 'Klebsiella pneumoniae', resistente a la mayoría de antibióticos de uso común.
http://www.europapress.es/salud/noticia-cientificos-espanoles-secuencian-genoma-completo-bacteria-resistente-antibioticos-20121204114330.html

2012. CSIC-comunicación.
Secuenciado el genoma completo de una bacteria resistente a los antibióticos.
Un equipo integrado por investigadores del Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC) ha obtenido la secuencia completa de una nueva cepa de la bacteria Klebsiella pneumoniae, resistente a la mayoría de los antibióticos de uso común. El trabajo, realizado en colaboración con científicos del Hospital La Paz de Madrid, la compañía Biomol-Informatics y el Parque Científico de Madrid, aparece publicado en el último número de la revista Journal of Bacteriology.
CSIC-comunicación

2012. BLOG mi+d Bio(Ciencia+Tecnología), JAL. BLOG del día 13 Nov. 2012
Secuencia completa de una cepa de la bacteria Klebsiella pneumoniae resistente a los antibióticos.
La aparición de bacterias resistentes a muchos de los antibióticos conocidos es cada vez más frecuente en hospitales de todo el mundo. La tecnología de secuenciación masiva de genoma completo que permite la precisa identificación de dichas bacterias es el primer paso hacia su control. Se ha obtenido la secuencia de una nueva cepa (bautizada como KpO3210) de la bacteria Klebsiella pneumoniae...
http://www.madrimasd.org/blogs/biocienciatecnologia/2012/11/12/132576

2012. Curso de Bioinformática impartido en el CITA - Zaragoza. 7-11 Mayo 2012.
Los contenidos del curso se centran en análisis de secuencias de DNA y proteínas, análisis de genes y genomas, diseño molecular 3D de proteínas y análisis de interacciones proteían-proteína y proteína-ligando.

http://www.cita-aragon.es/index.php/mod.noticias/mem.detalle/idnoticia.370/chk.53d8a333700459d0052ed4b777ac7239.html

2012. Entre probetas. RNE - Radio 5. Presentado por José Antonio López, JAL.
Entrada viral en célula - 16/04/2012

Los miembros de la familia paramixovirus son responsables de diferentes enfermedades humanas, como el sarampión, las paperas o distintas clases de neumonía. La entrada de material genético del virus en la célula necesita de la fusión de la membrana viral con la celular, un proceso mediado por la proteína F del virus.

http://www.rtve.es/alacarta/audios/entre-probetas/entre-probetas-entrada-viral-celula-16-04-12/1377172/  [Download / Descargar - MP3]

2012. Europa Press.
Investigadores del CSIC revelan el comportamiento de una región implicada en la multiplicación de bacterias.
Según han explicado los investigadores, el hallazgo puede ser utilizado en el desarrollo de nuevos antibióticos. La investigación, dirigida por Paulino Gómez-Puertas del Centro de Biología Molecular Severo Ochoa, ha contado con la colaboración de investigadores del Centro Nacional de Biotecnología del CSIC, el Hospital Universitario La Paz y la compañía Biomol-Informatics....
http://www.europapress.es/salud/noticia-revelan-comportamiento-region-implicada-multiplicacion-bacterias-20120330145249.html

2012. CSIC-comunicación.
Avanza la lucha contra las infecciones bacterianas.
El estudio con participación del CSIC contribuirá al desarrollo de nuevos fármacos. Una investigación dirigida por el Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC) ha logrado describir el comportamiento de un filamento de la proteína FtsZ. Esta molécula es la base de la estructura a partir de la cual una bacteria inicia su proceso de división y se multiplica...
CSIC-comunicación
[CSIC COVER / CSIC PORTADA 30-MAR-2012]
Nota de prensa (pdf 82kb) [Descargar]

2012. BLOG mi+d Bio(Ciencia+Tecnología), JAL.
Los primeros pasos de la unión de un virus a la membrana celular.
Los miembros de la familia de virus “paramixovirus” son responsables de diferentes enfermedades humanas, como el sarampión, las paperas o distintas clases de neumonía (virus respitatorio sincitial y virus de la parainfluenza). Un grupo multidisciplinar de científicos compuesto por biólogos, biotecnólogos y físicos, pertenecientes al Centro de Biología Molecular “Severo Ochoa” (CBM, CSIC-UAM) y a la empresa de base tecnológica “Biomol-Informatics”, ha descrito por primera vez un posible mecanismo...
http://www.madrimasd.org/blogs/biocienciatecnologia/2012/03/23/132253

2012. Entre probetas. RNE - Radio 5. Presentado por José Antonio López, JAL.
Oncogen Ras y cáncer - 13/03/2012

La proteína del oncogén Ras humano está implicada en un gran número de tumores malignos relacionándose a menudo con la aparición de metástasis.El estudio detallado de su funcionamiento puede abrir la clave para su su regulación farmacológica, mediante el diseño racional de fármacos.

http://www.rtve.es/alacarta/audios/entre-probetas/entre-probetas---oncogen-ras-cancer---13-02-12/1347696/

2012. BLOG mi+d Bio(Ciencia+Tecnología), JAL.
El oncogén Ras y su implicación en cáncer.
Un grupo multidisciplinar de científicos españoles compuesto por biólogos, biotecnólogos y físicos, pertenecientes al Centro de Biología Molecular Severo Ochoa (CSIC-UAM) y a la empresa de base tecnológica “Biomol-Informatics”, ha descrito por primera vez el mecanismo de acción de la proteína Ras humana con detalle atómico....

http://www.madrimasd.org/blogs/biocienciatecnologia/2012/02/11/132207

2011. La simulación computacional disminuirá en el futuro los experimentos reales en laboratorio. Un experto del CSIC explica en Salamanca los avances en diseño de fármacos mediante simulación por ordenador y otras aplicaciones de la Bioinformática...

http://www.dicyt.com/noticias/la-simulacion-computacional-disminuira-en-el-futuro-los-experimentos-reales-en-laboratorio
http://www.salamanca24horas.com/local/55192-la-simulacion-computacional-disminuira-en-el-futuro-los-experimentos-reales-en-laboratorio

2011. Game on! learning to fight real diseases in a virtual world. In the Madrid laboratory of Dr Paulino Gómez-Puertas, they are creating a virtual world using computer simulation to design artificial drugs that can help to cure diseases in the real world...

http://sociedad.elpais.com/sociedad/2011/09/15/actualidad/1316037622_850215.html

2011. Game on! Im Labor von Dr. Paulino Gómez-Puertas in Madrid erbauen Wissenschaftler eine virtuellen Welt. So sollen Modelle von Medikamenten entstehen, die in Zukunft ganz reale Krankheiten heilen. Von Paulino Gomez-Puertas, Universidad Autonoma de Madrid.

http://www.faz.net/aktuell/wissen/atomium-culture/medizinische-forschung-game-on-11188226.html

2009.
Conclusiones del 'Proyecto Combact' - Europa Press (in spanish)
Un total de quince grupos de investigación de la Comunidad de Madrid han participado durante cuatro años en el proyecto de investigación Combact que tiene como objetivo prioritario encontrar nuevas formas de combatir las bacterias resistentes a los antibióticos.

http://www.europapress.es/videos/video-conclusiones-proyecto-combact-20101019094923.html

2009.
FP7 PROJECT: DIVINOCELL - INVERVIEW Europa Press (in spanish)
PROYECTO FP7: DIVINOCELL - ENTREVISTA Europa Press.

http://www.europapress.es/videos/video-proyecto-divinocell-contra-bacterias-20090319152556.html



BIOWEB: MOLECULAR MODELING GROUP
Centro de Biología Molecular Severo Ochoa
(CBM, CSIC-UAM)
http://bioweb.cbm.uam.es
C/ Nicolás Cabrera, 1. Campus UAM, Cantoblanco
28049 Madrid. Spain
Tel: (+34) 91 196 4662 / 4663
Fax: (+34) 91 196 4420
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